第一，确定相宜的播种期。在温度相对较高的天气播种，并恰当稀播，则种子出苗快而飞快，秧苗相对粗壮，这在肯定程度上能减轻猝倒病的发生。
第二，床土消毒。育苗用的营养土必须经过长期堆制，最好能经过一个高温、潮湿的夏季，并用福尔马林溶液密封消毒。在床土运用前，可用4000一5000倍液的97％恶霉灵再次消毒。
第三，种子消毒。详细见问题。
第四，加强苗床管理。在出苗后降低苗床温湿度，使秧苗多照光。
第五，发病后及时用药进行防治。在发病初期，若是晴朗天气，一般用药剂喷防，可用75％百菌清可湿性粉剂600倍液，或50％多菌灵可湿性粉剂600倍液，或64％杀毒矾可湿性粉剂500倍液。如果是阴雨天气，或苗床湿度较大，床土潮湿，则喷药效果较差，这时可用干药土撒于苗床内，尤其是病苗附近，药土的配方一般是每平方米用50%多菌灵或75％百菌清8一10克拌干细土4一5千克。如果没有药土，则可撒清洁的干细土。
