并发感染或混和感染是当今猪病研究的热点，并发感染或混合感染是一个复杂的生物学问题。一般一种传染病的感染将加重另一种病的发生，尤其是一些免疫抑制病的感染，干扰动物免疫系统，从而加重其它病的发生，大量研究报道，圆环病毒病感染加重蓝耳病，蓝耳病加重猪瘟。所以对猪传染病并发感染必须进行综合分析和综合防治，由于病原的复杂，加上很多病毒性病病原的不断变异，有些疫苗（如蓝耳病等）效果不稳定等因素造成猪疫病控制难。因此，作为一个猪场最重要的是控制病原阻断病毒：即做好防疫隔离，消毒和淘汰病猪消灭病源；其次才是免疫注射。
关于非典型猪瘟并发感染的防治，首先是做好猪瘟的免疫监测和免疫注射控制猪瘟和非典型猪瘟（2型猪瘟病毒的发生）。一是对抗体水平低免疫后的母猪进行淘汰，保留免疫力强的母猪，使其所生仔猪获得充足的母源抗体的保护；二是适时免疫，仔猪4―5周龄进行首免，2周后加强一次免疫；三是防治蓝耳病和圆环病毒等免疫抑制性疾病的感染；四是选用好的兔化弱毒疫苗，足量注射。其次是对并发病进行病因分析，查明病因，对症防治，一般细菌性感染采用抗生素治疗，病毒性并发感染采用中草药（如清瘟败毒散等）进行治疗；另外，加强护理和营养供应，增强猪只体质加速康复。
