目前，青蟹养殖的苗种仍主要依赖自然海区的捕捞，多数是直接从海区捕获每只30克左右的小蟹用于养殖，浙江沿海有的捕捞青蟹大眼幼体进行培育成幼蟹后供养殖。苗种需经过严格选择，放养后的成活率高。详细要求是：（1）体质强壮，无伤残。质量好的青蟹苗种，甲壳呈青绿色，十足齐全，躯体完整无损伤，感觉反应敏捷，生活力强，不易捕抓。质量差的苗种甲壳呈深绿色或蓝绿色，有的腹部和步足为棕红色或铁锈色。步足缺少不能超过3个，游泳足和螯足更不能缺少或损伤，否则会影响青蟹的活动和觅食。如果步足断了一截，就应当把盈余的足肢在基节与座节之间关节处折断，新的附肢可能在短工夫内会再生出来。若不折除，盈余肢则会流出粘液影响水质，以至会引起死亡。凡受刺、钩、晒伤的均不宜选用，此类蟹死亡率高，即使幸存者，也需经较长工夫才能达到商品蟹要求。（2）无病。分辨病蟹多从步足基部肌肉色泽来区分。强壮的，其肉色呈蔚蓝色，肢体关节间的肌肉不下陷，具有弹性。病蟹则呈黄红色或白色，肢体关节间肌肉下陷，无弹性。（3）剔除蟹奴。青蟹腹节内侧基部常寄生有1-2个蟹奴。蟹奴呈卵圆形，体柔软，专门吸取寄主的营养维持生活。受寄生后，影响青蟹的生长和发育，故选择时应把蟹奴剔除掉。
