当前我国农业生产中，因劳动力老龄化导致饲养禽畜少、有机肥源少，种田几乎全用化肥。化肥成本低、见效快，对农业生产起到了较好的增产作用。这造成现在农业的施肥结构中，化肥用量逐年增加，用肥成本不断上升，土壤的供肥能力逐渐弱化。而在化肥的经营与应用中，还有一些不可忽视的问题。
对农资经销商而言，一是农资经营门槛过低，村里副食经营点没有农资经营许可证都可以随便买卖肥料，甚至有个人赶着骡马车拉着化肥直接到村叫卖，既串货又杀价，市场极为混乱；二是化肥品种杂乱，同质化严重，比如养分配比相同的复合肥料仅仅换一种包装就可卖出不同的价钱；三是个别企业用养分总含量的模糊概念欺骗农民，特别是在生物有机复合肥料中将有机质、微量元素与大量元素加在一起，，实际上氮、磷、钾等大量元素的含量很低；四是资金压力大，农民经常赊欠肥料款，一般乡镇农资经销商销售2000吨化肥的赊欠款达200余万元。
对农民而言，一是担心买到劣质肥料，如不法商贩在红色钾肥里掺入红砖粉沫；二是农村老年、妇女劳力多，要求肥料见效快，施用方法越简单越好；三是对于土壤肥力严重下降的问题，很少有人考虑改良。
为了改进肥料经营环境、促进土壤结构的改良。工商、农业主管部门尽快整顿肥料销售市场，规范经营秩序，坚决打击违法经营行为；严格监控肥料商品质量，严查严罚假冒伪劣肥料；农业主管部门要制定合理配方施肥方案、倡导多积多造有机肥、推广生物有机复合肥，培肥土壤地力，增强农业生产后劲。
