1、根系
木薯的根分为吸收根、块根和粗根三类（图1）。用种茎繁殖时，根从种茎基部切口处的皮层或从托叶痕两旁长出，称不定根，通常有20~60条，无主次之分。在不定根未形成块根以前，以及在块根形成之后乃至整个生长期间，从块根和粗根上长出的细根都称为吸收根，是粗细相似的纤维根，常为白色，具有根毛，是木薯植株吸收水分和养料的主要器官。
块根通称为薯，肉质，肥大，富含淀粉，是已经分化了的吸收根，其特点是出现了形成层，产生了次生结构，原来的初生木质部和初生韧皮部的交错排列被破坏，形成层不断分裂出大量细胞，使次生木质部薄壁细胞不断增加，根部不断增粗膨大，且大量积累淀粉，从而形成块根。
粗根是由不定根在分化膨大形成块根的过程中，受不良条件的抑制，使根部停止增粗膨大而形成，粗根也是已经分化的吸收根，有次生结构，次生木质部高度木质化，但导管很多，具有输导作用。
2、茎、叶、花果和种子
木薯的茎由节和节间组成，发生于种茎的腋芽，灌木状，直立，高1~4米，茎径2~5厘米，主茎有顶端分枝和侧分枝。叶为单叶互生，呈螺旋状排列，掌状深裂，裂片多为5~11片，披针形、椭圆形或线形等。木薯为异花授粉作物，雌雄同序异花，圆锥花序，着生于顶端分叉处，花梗疏散，果实为蒴果。
