红薯育苗是消费上的关键环节，培育无病壮苗是确保适时移栽，提高红薯产量和品质的重要内容。多年来，不少地方往往因红薯育苗期发生病害而造成苗源不足，种苗质量差，影响了红薯的正常消费。红薯苗床期病害主要有黑斑病、软腐病等。薯块带菌、病床感染、温度不适、湿度过大等是病害发生的主要原因。防止方法有以下几方面：
一、选择健薯。薯块上床前，要逐一选择无病、无伤、无冻害，表皮光润；大小适中、芽眼饱满的薯块作种薯。不要一拉子上床，以防止病薯感染健薯，引起薯块发病烂床。
二、温汤浸种。将选择后的薯块装入竹篮内，放入温水中，水温56～58℃，下水后将篮子上下提动，使其在2分钟内降到51～54℃，浸种10分钟。浸种时要严格操作，既要注意温度，又要保证工夫，使薯块表皮和芽眼深处的病菌全部烫死。一般每100公斤热水，一次可浸种10～15公斤。
三、药剂浸种。用40%多菌灵800～1000倍液，或50%代森铵200～300倍液，置于敞口容器内，浸种10分钟；或50%甲基托布津500倍液，浸种5分钟，能有效地杀死附着在种薯表面的病菌。
四川旧床灭菌。农家育苗时，往往是一次建床，多年利用，这样潜伏在旧床上的病菌成为主要侵染源，因此，在旧床利用前肯定要消灭病菌。一是用10%多菌灵可湿性粉剂300～500倍液，喷洒床底和四壁；二是在旧床清理后，用麦草等秸秆堆燃，利用高温熏蒸，杀死附着在床面上的病菌。
五、建造新床。在地势高燥、光照充足、管理方便的地方，建造新床。床底切忌铺垫旧床土和不卫生的草末碎粪，以防接触病原体染病。
六、增加隔离层。利用太阳能育苗或酿热温床育苗，排放的种薯不要与底层柴草和粪便接触。在酿热物和粪便踏实拍平后，上边覆上一层厚约8～12厘米的河沙或细净土，然后再排薯，以防病菌再侵染。
七、控制温度。育苗前期，气温较低，要做好提温保温工作。出苗前，薯层温度应保持32～35℃，若低于30℃时，要在晴天中午打开通气孔1～2小时，然后关闭，提高床温。当中午前后膜内温度达40～50℃时，要盖草苫遮光，打开气眼降温。出苗后，薯层温度保持25～30℃，膜内温度控制在35℃为宜。
八、调节水分。育苗期，苗床水分多，病害重、出苗慢。水分不足，引起床温降低，秧苗萎蔫，薯块糠心，易诱发病害。浇水的方法是轻、勤、细、匀，浇水以上午10时前为宜，中午前后温度高，不要用深进冷水泼浇，以浅坑塘水为准，避免床温骤降而引发病害。
九、推广高剪苗。消费上习惯于拔苗，拔后芽眼损伤，极易染病，采用高剪苗技术能防止病害的发生。高剪苗，一般留茬3.3厘米，剪后第二天浇一次水，剪第二次苗后，结合浇水追施少量速效氮肥，以促苗猛发，增加出苗数量。
